A pesquisa na EIC é centrada a partir dos grupos de pesquisas registrados junto ao CNPq.
Inicialmente os pesquisadores estavam alocados ao Grupo de Pesquisa em Computação Aplicada (GPCA).
Com o crescimento da pesquisa, em 2014 foi realizada a decomposição do GPCA em novos grupos para potencializar novas lideranças nas principais áreas estudadas.
Atualmente a EIC apresenta oito grupos de pesquisas:
[1] Data Analytics Lab (diretório do CNPq)
Líder: Eduardo Ogasawara (principal)
[2] Aprendizado de Máquina (diretório do CNPq)
Líder: Eduardo Bezerra (principal)
[3] Grupo de Pesquisa em Multimídia (diretório do CNPq)
Líder: Joel André Ferreira dos Santos (principal)
[4] Laboratório de Computação Afetiva – LaCAfe (diretório do CNPq)
Líder: Gustavo Guedes (principal)
[5] Otimização Combinatória e Aplicações (diretório do CNPq)
Líderes: Pedro Gonzalez (principal) & Vanessa de Almeida Guimarães
[6] Algoritmos, Complexidade e Modelagem Computacional (diretório do CNPq)
Líderes: Diego Nunes Brandão (principal) & Ana Luísa Carvalho Furtado
[7] Informática na Educação (diretório do CNPq)
Líderes: Carlos Schocair (principal) & João Quadros
[8] Engenharia de Software Baseada em Evidências (diretório do CNPq)
Líder: Rafael Maiani de Mello (principal)